Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRFP10586 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms