Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna6P07350 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms