Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBNO60934 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBNO60934 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBNO60934 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBNO60934 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBNO60934 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBNO60934 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBNO60934 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBNO60934 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBNO60934 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBNO60934 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBNO60934 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBNO60934 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBNO60934 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBNO60934 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBNO60934 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms