Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYNJ1O43426 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYNJ1O43426 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYNJ1O43426 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYNJ1O43426 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms