Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN3O15232 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN3O15232 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN3O15232 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN3O15232 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN3O15232 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN3O15232 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN3O15232 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN3O15232 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN3O15232 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN3O15232 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN3O15232 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms