Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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