Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMPOP42166 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms