Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC020912.1-201ENST00000638312 5059 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms