Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZCCHC17Q9NP64 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms