Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP2C1P98194 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms