Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms