Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NBR1Q14596 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NBR1Q14596 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms