Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP2C1P98194 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms