Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
V9GYV3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
V9GYV3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
V9GYV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
V9GYV3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
V9GYV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
V9GYV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
V9GYV3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
V9GYV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
V9GYV3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
V9GYV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
V9GYV3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms