Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HHLA3Q9XRX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HHLA3Q9XRX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms