Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pfdn5Q9WU28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn5Q9WU28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms