Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX12Q9UMY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX12Q9UMY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX12Q9UMY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms