Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFDP1Q9UEE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFDP1Q9UEE9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms