Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMOD2Q9NZR1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms