Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDE1Q9NZC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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