Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DUOX2Q9NRD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
DUOX2Q9NRD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DUOX2Q9NRD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms