Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf33Q9H7E9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf33Q9H7E9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms