Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN6Q9BZV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN6Q9BZV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms