Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TM2D3Q9BRN9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms