Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim12aQ99PQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim12aQ99PQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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