Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CSRNP1Q96S65 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSRNP1Q96S65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms