Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CICQ96RK0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms