Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD4Q96KN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms