Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHAMP1Q96JM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms