Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pth2Q91W27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pth2Q91W27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pth2Q91W27 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms