Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CKAP2Q8WWK9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP2Q8WWK9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP2Q8WWK9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms