Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C15orf40Q8WUR7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C15orf40Q8WUR7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms