Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF398Q8TD17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF398Q8TD17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms