Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF248Q8NDW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF248Q8NDW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms