Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms