Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C16orf54Q6UWD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms