Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A4Q6AI14 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A4Q6AI14 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms