Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC44A4Q53GD3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC44A4Q53GD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms