Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem109Q3UBX0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem109Q3UBX0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem109Q3UBX0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms