Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSM12Q3MHD2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSM12Q3MHD2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms