Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZIC1Q15915 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC1Q15915 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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