Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1EQ15878 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1EQ15878 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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