Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPTX1Q15818 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPTX1Q15818 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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