Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCLAFQ15004 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCLAFQ15004 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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