Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM25Q14258 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM25Q14258 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM25Q14258 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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