Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDE3BQ13370 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDE3BQ13370 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDE3BQ13370 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
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