Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 VPS38YLR360W 1320 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 NOP8YOL144W 1455 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 HXT2YMR011W 1626 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CSC1YLR241W 2349 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FET3YMR058W 1911 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FMP40YPL222W 2067 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FET4YMR319C 1659 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YGL242CYGL242C 546 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 BRR6YGL247W 594 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PEP8YJL053W 1140 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 VMA5YKL080W 1179 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 MED7YOL135C 669 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YOR263CYOR263C 408 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RRG7YOR305W 729 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RKM2YDR198C 1440 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RPT1YKL145W 1404 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CST9YLR394W 1449 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YHL017WYHL017W 1599 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ALG9YNL219C 1668 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ERG8YMR220W 1356 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CCT8YJL008C 1707 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ATF1YOR377W 1578 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 STB5YHR178W 2232 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 TMT1YER175C 900 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PGD1YGL025C 1194 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YJU3YKL094W 942 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ELO3YLR372W 1038 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ADD37YMR184W 597 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 MEI5YPL121C 669 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 GYP1YOR070C 1914 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YOL036WYOL036W 2286 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YMD8YML038C 1329 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YHR202WYHR202W 1809 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 BNA5YLR231C 1362 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 GUF1YLR289W 1938 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 IDS2YJL146W 1410 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FZF1YGL254W 900 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YGR149WYGR149W 1299 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ECI1YLR284C 843 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YBL096CYBL096C 309 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 LSC1YOR142W 990 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 TMA64YDR117C 1698 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CNA1YLR433C 1662 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FAA4YMR246W 2085 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CYC8YBR112C 2901 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ERP3YDL018C 678 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 NOP16YER002W 696 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YGL199CYGL199C 471 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 TYS1YGR185C 1185 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ASF1YJL115W 840 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YLR444CYLR444C 303 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PRM6YML047C 1059 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SSO2YMR183C 888 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CDC21YOR074C 915 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 LGE1YPL055C 999 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 POP7YBR167C 423 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 CDC19YAL038W 1503 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YIG1YPL201C 1386 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 AIM3YBR108W 2844 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RVB2YPL235W 1416 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SLT2YHR030C 1455 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ASP1YDR321W 1146 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SNO3YFL060C 669 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PUS6YGR169C 1215 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YAL069WYAL069W 315 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 LDB7YBL006C 543 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YML131WYML131W 1098 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PRE5YMR314W 705 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 MRPL17YNL252C 846 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SNO2YNL334C 669 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 FMP23YBR047W 528 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YPR123CYPR123C 435 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 PGK1YCR012W 1251 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 DTD1YDL219W 453 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 ECM11YDR446W 909 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YGL109WYGL109W 324 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YHR173CYHR173C 339 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 RPR2YIR015W 435 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 LDS1YAL018C 978 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SFT1YKL006C-A 294 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 TOA1YOR194C 861 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 SPR2YOR214C 711 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-NL1Q12391 AMD2YDR242W 1650 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PYC2YBR218C 3543 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RPL13AYDL082W 600 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SVP26YHR181W 687 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MRS1YIR021W 1092 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 LIA1YJR070C 978 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 HOC1YJR075W 1191 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 FYV12YOR183W 390 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YMC1YPR058W 924 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TRM11YOL124C 1302 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 IME4YGL192W 1803 nt5.64□□□□□ -1.51
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