Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	TPP1	YMR156C	717 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	KTR7	YIL085C	1554 nt		5.07	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	SUR2	YDR297W	1050 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	ACT1	YFL039C	1128 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	COS4	YFL062W	1140 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MTM1	YGR257C	1101 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YLR125W	YLR125W	411 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RPS31	YLR167W	459 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	COS3	YML132W	1140 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	HLJ1	YMR161W	675 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	NAT5	YOR253W	531 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	COS2	YBR302C	1140 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	OCT1	YKL134C	2319 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	AIM21	YIR003W	2040 nt		5.06	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YKR047W	YKR047W	306 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YLR407W	YLR407W	687 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RSF1	YMR030W	1131 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MFA2	YNL145W	117 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	BUD17	YNR027W	954 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	VPS68	YOL129W	555 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YPR015C	YPR015C	744 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YOL075C	YOL075C	3885 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	GGA1	YDR358W	1674 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	TSL1	YML100W	3297 nt		5.05	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	TRE1	YPL176C	2352 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	OCA4	YCR095C	1089 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	CWC2	YDL209C	1020 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	CPR1	YDR155C	489 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	AUA1	YFL010W-A	285 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	CNN1	YFR046C	1086 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	YPL162C	YPL162C	822 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	snR17b	snR17b	332 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	ATG26	YLR189C	3597 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RGP1	YDR137W	1992 nt		5.04	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MEF2	YJL102W	2460 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MET17	YLR303W	1335 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MIF2	YKL089W	1650 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	MRM1	YOR201C	1239 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	SIR1	YKR101W	1965 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	SKM1	YOL113W	1968 nt		5.03	□□□□□ -1.6
SYF1	Q04048	RIA1	YNL163C	3333 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	MDL1	YLR188W	2088 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	CDC21	YOR074C	915 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	DSS4	YPR017C	432 nt		5.02	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	TCM62	YBR044C	1719 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PHO12	YHR215W	1404 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PHO11	YAR071W	1404 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PCL9	YDL179W	915 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	NAT2	YGR147C	867 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YGR273C	YGR273C	525 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	DAN1	YJR150C	897 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YAR061W	YAR061W	204 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	BSD2	YBR290W	966 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	CWH43	YCR017C	2862 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	KCC4	YCL024W	3114 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	MUP3	YHL036W	1641 nt		5.01	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	IMD2	YHR216W	1572 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	RIP1	YEL024W	648 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	LOH1	YJL038C	660 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	VTA1	YLR181C	993 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	MDR1	YGR100W	2853 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PRM2	YIL037C	1971 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	AIP1	YMR092C	1848 nt		5	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	CNA1	YLR433C	1662 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	KIN28	YDL108W	921 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	MRT4	YKL009W	711 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	ARO80	YDR421W	2853 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	RSC58	YLR033W	1509 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	ECM32	YER176W	3366 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	YER158C	YER158C	1722 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	COX4	YGL187C	468 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	POL12	YBL035C	2118 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SYF1	Q04048	PTC1	YDL006W	846 nt		4.97	□□□□□ -1.61

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