Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN7AQ01118 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN7AQ01118 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms