Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AFDNP55196 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AFDNP55196 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AFDNP55196 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFDNP55196 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFDNP55196 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFDNP55196 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AFDNP55196 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFDNP55196 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFDNP55196 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFDNP55196 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFDNP55196 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFDNP55196 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFDNP55196 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFDNP55196 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFDNP55196 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms